激闘の末、拓也たちはついにケルビモンを倒した。しかし、デジタルワールドの虫食いだらけの大地は何も変わらない。原因を突き止めようと山に向かった拓也たちは、そこでバロモンと出会った。バロモンによると、ケルビモンが悪に染まった原因はルーチェモンにあるらしい。ケルビモンはルーチェモンによって、復活のためのデジコードを集めさせられていたというのだ。驚く拓也たちの前に、新たなる脅威・ロイヤルナイツが現れる！特集： デジモンフロンティア

拓也たちはロイヤルナイツの攻撃によって歪んだ時空に引きずり込まれ、デジタルワールドに三つある月の一つまで飛ばされてしまった。何とかデジタルワールドに戻ろうと試行錯誤するものの、良いアイディアは浮かんでこない。かつてバーガモンの仲間たちが使っていたロケットを再利用するしかなさそうだ。月にいるデジモンたちの協力を得て、帰還の準備を整える拓也たち。危険な電磁ストリームを抜け、無事デジタルワールドに戻ることが出来るのか？特集： デジモンフロンティア

月からの帰還を果たした拓也たちは、鋼のエリアへとやって来た。到着早々、山賊のサジタリモンが現れて身構える一同。しかしそこにエンジェモンを連れた4人の人間の子供たちが現れ、サジタリモンを追い払った。驚く拓也たちが話を聞くと、その4人もオファニモンに呼ばれた子供で、帰るように言われたにも関わらずデジタルワールドに居残っているのだという。しかもその中にいた勝春と鉄平の2人は、友樹には因縁の相手だった…。特集： デジモンフロンティア

勝春たち4人と友樹が、突如現れたロイヤルナイツにさらわれてしまった。ロイヤルナイツの行く先が豆の木村だと聞いた拓也たちは、トレイルモンに乗って後を追う。豆の木村で囚われの身となった友樹たちは、同じ捕虜であるマメモンたちに出会っていた。かつてマメモンたちは勝春たちから豆をもらい、それが芽を出し大きな木になるまで育てた。その木のデータをスキャンできないロイヤルナイツは、キーとなる部分の秘密を知りたがっているらしい…。特集： デジモンフロンティア

拓也たちは‘始まりの町’にやって来た。死んでいったデジモンのデータが戻り、デジタマとして新たな命をさずかる場所だ。一行は町を守るスワンモンと共にデジモンの赤ちゃんと接し、デジタルワールドを守りたいという気持ちを新たにする。そこにロイヤルナイツが現れた。ルーチェモンは命の輪廻さえ消滅させ、新たな世界を作ろうと考えていたのだ。あまりに非道な行為に、拓也たちの正義の心が燃え上がり、信じられない奇跡を起こす…。特集： デジモンフロンティア

ボコモンの故郷である‘炎の町’が狙われている！拓也たちが報せを聞いて駆けつけるると、隣にあったはずの緑の森は既にスキャンされ、ターミナルは避難してきたデジモンたちであふれていた。絶望感ただよう避難デジモンたちを、拓也たちは前向きになれと叱咤する。そこにロードナイトモンの手下・スカルサタモンが町を制圧しようと現れた。一同は心をひとつにして、強力な敵に立ち向かう！特集： デジモンフロンティア

ゴツモンはロイヤルナイツの手下であるナイトモン軍団に一人で立ち向かい、絶体絶命の危機に陥っていた。輝二たちはゴツモンを救い出すものの、デジタルワールドに残されたエリアは三ヵ所だけとなってしまっていた。残りの場所を死守するべく、誓いを交わす拓也たち。一行はゴツモンを加えて森のターミナルへと向かう。そのころロイヤルナイツは、結界によって守られているセラフィモンの城を前に、攻略のための策を練っていた…。特集： デジモンフロンティア

アキバマーケットにある氷のエリアのデータを守るべく、拓也たちは迎撃態勢を整えていた。住民を避難誘導する泉、データをスキャンさせないようにシャッフルする純平、戦いの役に立てようと投石器を作る友樹…。それぞれが今できることをやろうとしていた。そしてついに、ロイヤルナイツが姿を現した。立ち向かうカイゼルグレイモンとマグナガルルモン。戦闘の流れ弾に吹き飛ばされた輝一は、偶然にも自分に隠された秘密に気付いてしまう！特集： デジモンフロンティア

デジタルワールドに残された最後の場所・‘光のエリア’。そのデータはオファニモンの城にあった。デジタルワールドを救おうと、カイゼルグレイモンとマグナガルルモンは気迫を武器にロイヤルナイツを追い詰めてゆく。しかし勝てると思った瞬間、地中からの閃光に吹き飛ばされ、データのキーであるネフェルティモンをスキャンされてしまう…。そしてデジタルワールドは消滅した。ついにルーチェモンの封印が解かれてしまったのだ！特集： デジモンフロンティア

拓也たちはトレイルモンに乗って、崩壊したデジタルワールドから月へと撤退した。そこでオファニモンやケルビモンの生まれ変わりである赤ちゃんデジモンたちと触れ合い、最後まであきらめずにロイヤルナイツに立ち向かおうと心に誓う。そして始まった月面での激闘。カイゼルグレイモンとマグナガルルモンは今度こそ勝利を掴み、ロイヤルナイツの身体にデジコードが浮かんだ。それをスキャンしたのは…。特集： デジモンフロンティア

フォールダウンモードへと進化したルーチェモンの攻撃によって、三つの月が崩壊した。拓也たちはパタモン、ブロットモン、ロップモンの助けを得て難を逃れ、ルーチェモンを追ってデジタルワールドのダークエリアへと向かう。人間界へ攻め込もうとするルーチェモン。六闘士は阻止せんと戦いを挑むが、歯が立たずに返り討ちにあってしまう。光と闇を一つにすれば勝機があるかもしれない…。そう思った輝一は、捨て身の行動に打って出た！特集： デジモンフロンティア

輝一の犠牲をきっかけに、拓也と輝二と十闘士のスピリットが融合して最強の闘士が誕生した。その名はスサノオモン。こうして始まった最終決戦は一進一退の攻防を繰り広げたが、スサノオモンがルーチェモンの必殺技を破り、自らの必殺技でルーチェモンを打ち倒した。ルーチェモンを浄化するスサノオモン。戦いはこれで終わったかに思えたが、邪悪なデータはスキャンされず、サタンモードへと変化してしまった！特集： デジモンフロンティア

人間界へと到達したルーチェモンを止めようと戦いを挑んだものの、その不死身の身体にはダメージが与えられない。悔し涙が止まらない拓也たちの前に現れたのは、アグニモンたち伝説の十闘士だった。ようやく出会えたもう一人の自分。拓也たち五人と十闘士は新たな闘志を燃え上がらせ、エンシェントスピリットエヴォリューションによって最強のスサノオモンへと進化した。そして彼らは、破壊本能で動くサタンモードに最後の戦いを挑んでゆく！特集： デジモンフロンティア