千晶が激怒!? どうやらスマホでカンニングした生徒を見つけたらしく、いつもと違う雰囲気に驚くクラスメイトたち。そして事態はスマホの持ち込み禁止を徹底するか否かを決める、生徒総会へと雪崩れ込む。青木の無責任な優しさで増長する一部の生徒たち。厳しい態度を崩さない千晶。どうなる!? 生徒総会！

骨董屋さんが仕入れてきた怪しげなランプ。聞けば百年に一度見られるかどうかの映像が見れる代物という。それはなんとアパートにいながらにして、大空を駆け、砂漠にそびえる異形の城を目撃できる不思議なランプだった！ 世界は広いと感じる夕士だが、更に驚く体験が待っていて…!?

「おめでとうございます、抽選にあたりました！」突然現れた天使（？）の導きにより、死んだはずの＜ぼく＞の魂は自殺してしまった少年、小林真の体に入り込み、現世にもどる再挑戦をすることに。 ＜ぼく＞は真として彼の生活を体験する中で、やがて彼が死を選んだわけを知り、この再挑戦の本当の意味を考え始める…。

文化祭が近づき、クラスの催し物を考える夕士たち。千晶先生の丸投げ姿勢にみんなはびっくりするが、夕士はそこに自分たちへの信頼を見て、改めてそれに応えようと思う。そんな中、英会話クラブへの欠席が続く小夏を気にかける夕士。次第に彼女が「メッキ」をまとう理由が見え始めて…。

地球では、はるかかなたから降ってきた“宇宙の石”が大ブーム！ 大もうけしようとたくらみ、海の底で宇宙の石を探しはじめたゾロリたちであったが、ひょんなことから、な・な・な・なんと宇宙まで行っちゃった!! ゾロリたちが辿り着いたのは謎の星、ムムーン星。そこで美少女・クララに一目ぼれしたゾロリは、彼女のハートをゲットするため、星に住みついた<巨大怪獣退治>を引き受けてしまう…。ゾロリはイシシ・ノシシとともに、巨大怪獣をやっつけて、無事に宇宙から地球に帰ることはできるのか!?

屋上から飛び降りようとしていた少女・浅田有実を助けた夕士。メイクばっちりの派手な格好で大人びているが、まだ小六だという！ なぜかなつかれてしまった夕士は、英会話クラブの催しに一緒に連れていくことになる。だが意外にも有実は、そこで広い世界の一端を知ったようで……？

学業と修行に明け暮れる中、訪れる三連休。だが夕士にとっては稼ぎ時！ みっちりバイトに励む夕士が頼まれたのは、新人バイト2人の教育係だった。しかし視線を合わせず、話を聞いているのかも分からない2人に不安を覚える夕士。そんな最中、クレームが入り新人たちのミスが発覚してしまう！

中秋の名月を愛でる秋がきた！ サンマ、キノコ、梨に栗にと味覚の秋を堪能すべし！ そして何よりお団子だ～！ と、お月見の準備で餅つきを始める寿荘。そんな中、秋音の師匠・藤之先生と、バイト先である病院の患者さん達もお月見にやって来た。妖怪と人間の入り混じるお月見で、夕士は生きることの意味に想いを馳せる…。

青木先生から、両親を失って苦労している“はず”だと言われた夕士。善意からかけられる優しい言葉だが、そう思っていない夕士は、一面だけを見て決めつけ、押し付けられる「善意」に苛立つ。厳しくする事も、何もしない事も、時には優しさではないのか？ 一色さんの言葉はそのキーワードのようで……。

常軌を逸している三浦に一体何がおこったのか？ 再びプチ・ヒエロゾイコンからコクマーを召喚し探っていく夕士。寿荘の面々にも相談しつつ真相に迫っていく。小部屋の落書きの念。蓄積した負の感情は「イドの怪物」となって器を探し求めていたのだった……！

クラッシャー・ジョウは、名門スコーラン家の執事からある依頼を受ける。しかし、ミッコラへ向かう途中でジョウたちの宇宙船は操縦不能に陥ってしまう。その後、海賊の容疑をかけられクラッシャーの資格を停止されたジョウは、姿を消した執事が宇宙海賊の一員と知り、無法者が集う惑星ラゴールに乗り込むのだった！

田代たちと話していたら新任教師の三浦に怒鳴られた夕士。納得いかない気持ちだったが、その時に話していた学校の怪談が気になり、調査に乗り出す。ノルン3姉妹を呼び怪談について占ってみると、なにやらドロドロした物を感じるという。そして夕士は田代と演劇部の物置で「女を呪う言葉」の落書きを見つけてしまい……。

紺野真琴は、あるきっかけで過去に遡ってやり直せる『タイムリープ能力』を持ってしまう。使い方を覚えると、日常の些細な不満や欲望に費やしてしまう。バラ色の日々…のはずが、親友の千昭から告白を受け動揺した真琴は、タイムリープで告白を無かった事にしてしまう。やがてそれがとんでもない事件を招く事になり…。

夏休みも終わって新学期。学校まで付いてくるフールを他人に見られないかドキドキしながら登校する夕士は、他校から赴任してきた教師・三浦の「仄暗い」感じが妙に引っかかる。そんな折、この世界とは位相を異にする隠れ里から、又十郎と呼ばれる巨人がやってきた！

魔道書の主となってしまった夕士だが、ひょんなことからそのことが親友の長谷にバレてしまう！　妖怪アパートに住んでいることをついに告白しないといけないが…。そんな中、魔道士の修業のための霊力特訓まで始めるハメに！

ついに長谷がアパートにやって来た！ 寿荘の人たちへ気の利いたプレゼントを持参するが、ここに住む妖怪・幽霊・精霊といった不思議な存在を受け入れてくれるのか、夕士はドキドキ。そんな長谷は、子供の幽霊・クリの可愛さにメロメロになってしまって――？

寮に引っ越した夕士は改めて普通の生活に戸惑ったり、寮での人間関係にギクシャクしたりして思い悩む。そんな折、人間社会でサラリーマンとして働いている幽霊・佐藤さんと街で再会する。そして確執を抱えていた従姉妹・恵理子とも再会するが……。

子供の幽霊・クリと、犬の幽霊・シロはいつも一緒。だがその理由は、クリが死んだ原因にあるようで……。妖怪アパートに現れたクリの母と対峙することになった夕士は、自分にはもういない子を思う母親の愛情に思いを馳せる……。

寮が建て直され、夕士がアパートを出ていく日が迫る。アパートの面々による賑やかで、心温まる送別会。さらに心の籠った餞別を貰う夕士。さようなら妖怪アパート。かくして夕士の「こっち側」の生活が始まる。