徳川幕府存続のために生まれた奴隷忍者計画。それを阻止すべく動き出す元豊臣方の忍びたち。人を襲う疫病が蔓延する中、新人くの一、彩芽は凄惨な戦いに巻き込まれていく…。人気セクシー女優、川越ゆい、映画デビュー！ロリセクシー女優として頭角をあらわす荒木まい、アクション女優としての地位を築きつつあるあやなれい共演で贈るくの一エンタテイメント！ストーリー関ヶ原の戦いより数年後、ようやく戦乱が忘れられようとする時代――徳川家康の側近である天海僧正は、幕府存続の為に強大な奴隷忍者軍団を形成し、関東一円を支配しようとしていた。一方、関ヶ原の戦いでは豊臣方に付き、逃走した忍びの集団が山奥に独自の村を築いていたが、その一つが疫病に悩まされており、その調査の為にくノ一たちを差し向ける……。くノ一のひとりである彩芽（あやめ）は、仲間であるサツキ、楓（かえで）と共に疫病の村に赴くが、そこで天海の手下である奴隷忍者軍団＜邪門衆＞と遭遇、彩芽は血を弾丸のように発射する忍法で撃退するが、それはくノ一VS邪門衆という戦いの火種となってしまった……。

ストーリー関ヶ原の戦いより数年後、徳川家康の側近である天海僧正は、幕府存続の為に強大な忍者軍団を形成し、関東一円を支配しようとしていた。一方、関ヶ原の戦いで豊臣方に付いた忍びの子孫である彩芽（あやめ）、サツキ、楓（かえで）は、疫病による村の滅亡を食い止めようと、別藩に助けを求め奔走する。しかし、あらゆる場所に天海の追手が立ちふさがる。彩芽は仲間である新兵衛たちと合流し、ついに天海の野望を知る――「天海は大量の黄金を運ぶ為に、各地の忍びの村を襲い仲間を増やしている……」新兵衛は、天海へ反逆する意志のある者を江戸で探すしかないと語るが、そのとき新兵衛の部下のひとりが何者かに殺されてしまった。「この中に裏切り者がいる」――忍びたち全員がお互いを疑いあう、一触即発の状態となった。天海の呪術を見抜くには、＜血のわけあい＞しかない。それは、呪術に毒された体に、他人の血が混ぜて判別する儀式だ。その場の全員が手首を切り、天海の奴隷忍者‘アラズモノ’を見分けよう’とするが……！？第1作のセクシーアクションに加え、＜誰が裏切り者なのか＞というサスペンスフルな展開が加わり、凄味を増した忍戦帖シリーズ第2弾。次々と変転するくノ一たちの運命から目を離せない！